19 мая 2004 года проигнорировал ежегодный съезд предпринимателей Алтайского края в Барнауле, в котором традиционно принимали участие главы региона. Участники съезда восприняли это как "невнимание к проблемам сообщества".
В июне 2004 года уладил спор между московским скульптором Вячеславом Клыковым и алтайскими археологами, которые не могли договориться о месте для памятника писателю Василию Шукшину в селе Сростки Бийского района. Господин Клыков хотел поставить изготовленный им памятник на горе Пикет, но археологи были против, так как под горой находится скифский курган. Михаил Евдокимов распорядился установить памятник на горе, а после празднования 75-летия писателя перенести его на обочину Чуйского тракта. Скульптор Клыков пообещал в случае переноса памятника забрать его в Москву.
30 июля 2004 года отметил 100 дней во власти лекцией "О положении и перспективах развития региона". Пообещал укрупнить районы края, ввести "пятилетку развития" и наладить добычу нефти и угля.
3 ноября 2004 года отказался подписать принятый краевым советом закон о повышении зарплаты региональных чиновников. Но уже 22 ноября согласился это сделать, пояснив, что повышает зарплату только потому, что в бюджете на 2005 год "заложен механизм роста доходов всех земляков".
За первые девять месяцев пребывания у власти — с апреля 2004 по январь 2005 года — сменил шестерых им же назначенных вице-губернаторов. По мнению депутатов крайсовета, это привело к "резкому снижению темпов промышленного роста и сокращению поголовья скота".
11 марта 2005 года Михаилу Евдокимову впервые в истории краевого парламента удалось объединить фракции КПРФ, СПС, "Единая Россия" и аграриев. В этот день они распространили заявление, в котором обвинили губернатора в "самоустранении от руководства краевой администрацией" и призвали его добровольно подать в отставку.