Совет по науке при президенте разрешил конфликт между Министерством образования и науки и Российской академией наук (РАН). Угроза ликвидации нависла над РАН в сентябре, когда коллегия Минобрнауки одобрила "Концепцию участия Российской Федерации в управлении государственными организациями, осуществляющими деятельность в сфере науки". Как следовало из "Концепции...", РАН с 2008 года вообще не было места в российской науке нового образца, которая должна была существовать исключительно на самостоятельно заработанные учеными деньги. Это вызвало резкий протест со стороны академиков и общероссийскую акцию протеста ученых 20 октября с требованием отставки министра Андрея Фурсенко. Нобелевские лауреаты академики Виталий Гинзбург и Жорес Алферов направили письмо Владимиру Путину с просьбой лично вмешаться и защитить от посягательств со стороны министерства на сам принцип госфинансирования Академии наук вне зависимости от экономической эффективности ее исследований. По мнению академиков, фундаментальные академические исследования государство должно оплачивать и впредь, как это оно делало предыдущие 280 лет с момента учреждения Академии наук указом Петра I в 1724 году.