16 июня 1998 года в Санкт-Петербурге шестью выстрелами убит Николай Болотовский, председатель совета директоров ОАО "НИАИ 'Источник'", разрабатывающего аккумуляторные батареи для оборонного комплекса. По версии следствия, преступление совершила банда депутата городского законодательного собрания Петербурга Юрия Шутова, который якобы хотел получить контроль над заводом. Господин Шутов с 26 февраля 1999 года находится под стражей. Следствие по его делу продолжается.
10 июля 2000 года в Екатеринбурге в собственной машине расстреляны генеральный директор одного из крупнейших оборонных предприятий страны — завода "Уралмаш" — Олег Белоненко и его водитель. По данным милиции, убийство связано с производственной деятельностью: став гендиректором "Уралмаша", он начал отсекать от бизнеса криминальных партнеров. Следствие по делу продолжается.В ночь на 17 сентября 2001 года в городе Большой Камень (Приморский край) зарезан директор завода по ремонту, утилизации и демонтажу атомных подводных лодок "Звезда" Валерий Маслаков. Убийство совершил приемный сын Маслакова, будучи в нетрезвом состоянии. По мнению следствия, преступление произошло на бытовой почве. Прорабатывалась также версия тщательно спланированного заказного убийства.
4 октября 2002 года найден повешенным в своем гараже в Самаре генеральный директор машиностроительного завода "Металлист-Самара" Владимир Китайкин. Завод "Металлист" является оборонным предприятием системы "Росавиакосмоса" и выпускает форсажные камеры и другие узлы крупных авиационных двигателей и камеры сгорания жидкостных ракетных двигателей. Следствие не смогло классифицировать происшедшее как убийство или самоубийство. По данным некоторых СМИ, причиной смерти господина Китайкина мог стать конфликт между акционерами завода.