Некоммерческая организация «Правовая инициатива по России» создана в 2001 году в Нидерландах со штаб-квартирой в Москве. Имеет представительство в Назрани (Ингушетия), зарегистрированное 7 октября 2005 года. В феврале 2011 года Минюст России исключил организацию из реестра иностранных НКО, в настоящее время фонд работает через две российских НКО — «Правовое содействие — Астрея» (директор — экс-сотрудник Human Rights Watch Ванесса Коган) и «Правовая инициатива» (Назрань; директор — Магомед Барахоев). Фонд сотрудничает также с рядом правозащитных организаций, включая «Мемориал», Chechnya Advocacy Network, Human Rights Watch, «Права женщин» и другие.
Основными источниками финансирования деятельности являются гранты и помощь, оказываемая несколькими благотворительными фондами, а также правительствами зарубежных стран. Согласно последнему доступному отчету за 2015 год организация получила гранты на сумму €887,9 тыс. По данным СПАРК, в 2017 году платежи по текущим операциям НОФ «Правовая инициатива» составили 9,4 млн руб.