13 октября 2005 года около 150 боевиков атаковали 13 объектов в Нальчике, включая аэропорт, подразделения ФСБ, МВД, погранотряд. Атака была отбита, 95 нападавших убиты. Погибли 35 сотрудников правоохранительных органов и 15 мирных граждан, более 220 человек получили ранения. Ответственность за штурм взял на себя Шамиль Басаев. За год задержали более 70 предполагаемых участников нападения.
В 2006 году 12 задержанных были освобождены по амнистии. 59 задержанным (один позже умер) предъявили обвинения по ст. 105 (убийство), ст. 205 (терроризм), ст. 209 (бандитизм), ст. 208 (участие в незаконных вооруженных формированиях), ст. 222 (незаконный оборот оружия) и другим статьям УК РФ.
11 октября 2007 года в Верховном суде КБР начались предварительные слушания по делу. Более года суд пытался сформировать коллегию присяжных: более чем из 2 тыс. кандидатов счел подходящими 15 человек. 18 февраля 2009 года, сославшись на поправки к УПК, отменявшие присяжных в делах о терроризме, суд принял решение о рассмотрении дела коллегией из трех судей. 18 марта судебная тройка начала рассмотрение дела по существу.
В 2010-2011 годах суд по состоянию здоровья отпустил под подписку о невыезде четырех подсудимых. Дело в отношении еще одного, заболевшего туберкулезом, выделили в отдельное производство. Остальным неоднократно продлевались сроки содержания под стражей.
6 июня 2013 года Европейский суд по правам человека по жалобе 50 родственников боевиков признал нарушением Европейской конвенции по правам человека отказ российских властей от выдачи тел убитых для захоронения и обязал Россию оплатить издержки в размере €15 тыс.
19 августа 2013 года начались прения сторон. Гособвинение просило для семи подсудимых пожизненного заключения, для остальных — от 4 лет 6 месяцев до 23 лет заключения. 10 января 2014 года суд завершил рассмотрение дела. 23 декабря 2014 года пять человек получили пожизненные сроки, остальные — от 4 лет 10 месяцев до 23 лет, трое вышли на свободу по причине отбытия наказания.