Александр Конаныхин родился в городе Осташков (Тверская область) в 1966 году в семье научных работников. Ребенком он был одаренным и в школе учился на круглые пятерки. Особенно его привлекали математика и физика. На школьных олимпиадах по этим предметам Конаныхину не было равных. В 1983 году будущий хозяин ВББ участвовал во Всероссийской олимпиаде по физике и занял четвертое место. В том же году Конаныхин поступил в МФТИ. В институте он учился так же хорошо, как и в школе. Но через три года его неожиданно отчислили из вуза и выгнали из комсомола — "за поведение, недостойное звания советского студента". По некоторым данным, отчисление было связано с тем, что Конаныхин организовал из участников студенческого стройотряда несколько бригад, которые подрабатывали обработкой огородов и строительством. Значительную часть заработанных шабашниками денег Конаныхин присвоил, и студенты написали на него жалобу в деканат.
Конаныхина хотели призвать в армию, но он предусмотрительно женился, усыновив двух детей своей супруги от первого брака. Брак не был фиктивным, и в семье Конаныхиных вскоре появился третий ребенок.
В 1991 году Конаныхин развелся с женой, а еще через год в Канаде зарегистрировал новый брак. Интересная деталь: по словам его бывшей супруги, Конаныхин говорил ей, что работает в строительном кооперативе, хотя на самом деле в то время уже руководил одним из крупнейших банков страны. Проблемы оставленной семьи Конаныхина не интересовали. Он вспомнил о бывшей супруге лишь в 1992 году, когда она лежала в больнице. Банкир передал ей конверт, в котором лежали четыре тысячи рублей, и скрылся.