В 1987 году господин Михалков создал творческо-производственное объединение «Тритэ», занимающееся кино- и телепроизводством. В настоящее время он является председателем правления ООО «Студия “Тритэ” Никиты Михалкова» (по данным Kartoteka.ru, режиссеру принадлежит в компании более 65%).
В конце 1990-х—начале 2000-х годов Никита Михалков, по данным СМИ, был председателем совета директоров группы «Никос», в которую входили химзаводы «Каустик» и «Пласткард». С 2002 года он являлся председателем совета директоров сети киноплексов «Синема Парк». С 2004 года по 2013 год входил в совет директоров ОАО «Первый канал». С 2007 года режиссер входит в совет директоров банка «Возрождение», является членом комитета по кадрам и вознаграждениям совета.
В 2010 году возглавляемый господином Михалковым Российский союз правообладателей получил аккредитацию на сбор 1% со стоимости звукозаписывающей техники и чистых носителей.
В 2013 году стало известно, что совместно с нижегородским предпринимателем Константином Тувыкиным режиссер приобрел в Тоскане старинную винодельню и 25 га легендарных виноградников Monteregio di Massa Marittima. Объемы производства оцениваются в 16 тыс. бутылок в год, а марки вина носят названия фильмов режиссера.
По данным ЕГРЮЛ, Никита Михалков является владельцем 10% ООО «Челпром-Даймонд», входящего в десятку самых крупных в России алмазообрабатывающих предприятий. Кроме того, по данным Kartoteka.ru, режиссеру принадлежит учрежденное в 2012 году в Нижегородской области ООО «Темино-Павловское» (лесозаготовка) и 7,5% в ООО «Брэдбери Лаб» (Москва, разработка программного обеспечения и консультирование в этой области).
Журнал Forbes оценил его доход за 2012 год в $ 2,7 млн.