Родился в 1906 году в Смирне (ныне Измир, Турция) в семье Сократа и Пенелопы Онассис. Владел крупнейшим в мире частным флотом нефтетанкеров. В 1956 году создал авиакомпанию Olympic Airways (в 1975 году передал ее греческому государству).
В 1946 году женился в первый раз — на Афине Ставру Ливану. От этого брака имел двоих детей — сына Александра (1948-1973) и дочь Кристину (1950-1988).
В 1968 году женился вторично — на Жаклин Бювье-Кеннеди, вдове президента США Дж. Ф. Кеннеди.
Скончался в Париже 15 марта 1975 года. Похоронен в семейной усыпальнице на острове Скорпиос (там же похоронены его дети и сестра Артемида)