В 1997 году мэр Москвы Юрий Лужков дважды отверг предложенную Академией художеств Зураба Церетели смету на оформление храма Христа Спасителя (ХХС). Первоначально академия запросила 4,3 млрд руб., а через несколько недель снизила оценку до 372 млн руб. Мэр заявил, что за такие деньги сам будет "спокойно лежать на лесах с кистью в руках". В результате роспись храма обошлась в 230 млн руб.
В январе 2003 года газета "Известия" сообщила о существовании "Плана привлечения средств для расчетов за выполненные работы по воссозданию ХХС", якобы подписанного руководителем Москомимущества. Основываясь на документе, газета предполагала, что взносы на воссоздание храма не всегда платились добровольно.
В мае 2009 года под храмом открылся "центр изящных искусств" Volkhonka Fine Art Centre площадью 2,35 тыс. кв. м, предлагающий клиентам проведение выставок и музыкальных вечеров. В ноябре 2011 года фотограф Геннадий Авраменко опубликовал в блоге репортаж "VERTеп в Храме" с рассказом о прошедшей в арт-центре вечеринке с "газовыми факелами, алкоголем и светскими львицами", посвященной выходу нового телефона Vertu.
В январе 2012 года ключарь ХХС протоиерей Михаил Рязанцев раскритиковал фонд храма Христа Спасителя, который, по его словам, "узурпировал деятельность по привлечению благотворителей". Он назвал фонд "совершенно далекой от церкви организацией", которая, однако, управляет всем недвижимым имуществом храма.