Весной 2008 года бывшая сотрудница правового управления НК ЮКОС Светлана Бахмина, отсидевшая более половины из назначенных ей судом 6,5 лет колонии, обратилась с ходатайством об условно-досрочном освобождении (УДО). В прошении она указала, что не нарушала режим, добилась успехов на производстве, писала заметки в тюремную газету и шила платья для спектаклей. Дело поступило в Зубово-Полянский райсуд Мордовии, где осужденная отбывала наказание. Общественная кампания в ее защиту, одобрение УДО администрацией колонии и местной прокуратурой, а также беременность госпожи Бахминой были дважды (в мае и сентябре) проигнорированы судом. При этом по ходу процесса она в связи с предстоящими родами была помещена в одну из больниц Московского региона. 4 марта 2009 года в ходе третьего рассмотрения мордовский суд вообще отказался от этого дела, переправив его по месту нахождения госпожи Бахминой в Москву. 21 апреля 2009 года Преображенский суд столицы вынес положительное решение.
В июле 2008 года ходатайство об УДО подал сам экс-глава ЮКОСа Михаил Ходорковский. В августе Ингодинский райсуд Читы отклонил прошение. Поводом послужило неснятое взыскание за невыполнение команды сотрудника администрации СИЗО заложить руки за спину во время прогулки. Также суд счел негативным признаком тот факт, что господин Ходорковский упорно отказывался получать профессию швеи-моториста.
В июне 2010 года бывший замглавы дирекции внешнего долга ЮКОСа Владимир Переверзин, приговоренный к 11 годам заключения, подал прошение об УДО в Октябрьский райсуд Владимира. На следующий день администрация колонии объявила, что на бывшего менеджера возложено взыскание и его просьба является недействительной. Причиной наказания было названо то, что господин Переверзин обматерил другого заключенного.