В 1998 году пост советника президента "Роснефти" Сергея Богданчикова получил сын губернатора Хабаровского края Виктора Ишаева Дмитрий. Он проработал в компании до начала 2000-х годов, после чего занялся собственным бизнесом.
В январе 1999 года советником Сергея Богданчикова стал генерал ФСБ Резо Турсунов. Широкую известность он получил годом ранее, когда президент Узбекистана Ислам Каримов обвинил господина Турсунова в организации мятежа на севере Таджикистана c целью испортить отношения между двумя странами. В 2000 году Резо Турсунов занял должность вице-президента компании, в 2005 году стал членом правления.
В июне 2004 года в управление по оценке и операциям с активами пришел сын Сергея Богданчикова Алексей. Он покинул компанию в 2009 году, будучи уже главой управления по работе с инвесторами. Свой уход Алексей Богданчиков объяснил невозможностью карьерного роста в одной компании с отцом.
В сентябре 2006 года сын главы ФСБ Николая Патрушева Андрей был назначен советником председателя совета директоров "Роснефти" Игоря Сечина. До этого господин Патрушев-младший служил заместителем начальника 9-го, так называемого нефтяного отдела управления "П" ("Промышленность") ФСБ РФ.