Ледокольный флот является государственной собственностью, которая передана в оперативное управление Мурманскому морскому пароходству. Обеспечением флота топливом и другими ресурсами, необходимыми для энергетических установок, занимается ФГУП "Атомфлот".
Информационное обеспечение СМП осуществляют государственные службы метеоразведки, ледовой разведки и авиаподдержки (поиск и спасение). Общий объем их финансирования оценивается в 105 млн руб.По трассе СМП осуществляется завоз товаров первой необходимости в города арктического побережья 29 регионов. С 1989 года из-за сокращения объемов перевозок по СМП объемы перевалки грузов в портах Арктики сократились на 90%. Сейчас рентабельным считается только один порт — Дудинка в устье Енисея.