Вторая чеченская кампания официально началась 23 сентября 1999 года после подписания президентом РФ Борисом Ельциным указа о создании объединенной группировки войск и сил (ОГВ) на Северном Кавказе и подготовке контртеррористической операции на территории республики. Она длилась 3493 дня.
Численность федеральных сил на начальном этапе операции составляла 93 тыс. человек. Численность боевиков в 1999 году оценивалась военными в 15-20 тыс. человек. В 2009 году официальные власти заявляют, что в республике находится от 50 до 500 непримиримых боевиков.
Общие потери силовых структур в ходе активной фазы боевых действий (с октября 1999 года по 23 декабря 2002 года) составили 4572 погибшими и 15 549 ранеными. По статистике Минобороны, с 1999 года по сентябрь 2008 года при исполнении служебных обязанностей в республике погибли 3684 военнослужащих. По данным главного управления кадров МВД, потери внутренних войск в августе 1999--августе 2003 года составили 1055 человек. Потери МВД Чечни, по данным на 2006 год, оценивались в 835 человек убитыми. Также сообщалось, что в 1999-2002 годах в Чечне погибли 202 сотрудника ФСБ. Таким образом, потери российских силовых ведомств можно оценить как минимум в 6 тыс. человек.
В 1999-2002 годах, по данным штаба ОГВ, уничтожено 15,5 тыс. боевиков. За последующий период, с 2002 по 2009 годы, силовики отчитались о ликвидации еще около 2100 членов незаконных вооруженных формирований: основная часть в 2002 году (600) и 2003 году (700). В то же время лидер боевиков Шамиль Басаев в 2005 году заявил, что потери чеченцев составляют 3600 человек. Жертвы среди мирного населения правозащитная организация "Мемориал" в 2004 году оценивала в 10-20 тыс. человек, не считая 5 тыс. пропавших без вести.
Официальные данные о стоимости операции в Чечне отсутствуют. В ноябре 2002 года зампред комитета Госдумы по обороне Алексей Арбатов сообщил, что в период активных боевых действий (осень 1999--зима 2000 года) на контртеррористическую операцию уходило 20-30 млрд руб. в год, затем расходы снизились до 10-15 млрд руб. В докладе экс-депутатов Руслана Хасбулатова и Ивана Рыбкина "Экономические аспекты войны в Чечне" от апреля 2003 года сообщалось: на развертывание войск и боевые действия с сентября 1999 года до конца 2000 года ушло $10-12 млрд, в 2001 году — $11-13 млрд, в 2002 году — $10-12 млрд, за три месяца 2003 года — около $3 млрд.