Сеть неоднократно становилась объектом критики со стороны властей разных стран. Президент России Владимир Путин в апреле 2014 года призвал развивать общепит на основе национальной кухни для конкуренции с McDonald`s. Лидер Венесуэлы Уго Чавес в 2010 году на несколько дней закрыл все 115 точек сети в стране.
С середины 1980-х в ряде стран 16 октября проходил Всемирный день борьбы с McDonald`s. Перед ресторанами проводились акции против "нездоровой пищи".
В августе 1994 года 81-летняя американка Стелла Либек отсудила у компании $2,9 млн. Она пролила на себя кофе, пытаясь снять крышку со стакана, и получила ожоги третьей степени. Адвокаты истицы доказали, что в ресторанах сети кофе слишком горячий — 82°C против 60°C в других заведениях. Позже выплаты сократили до $600 тыс.
В июле 2003 года группа страдающих ожирением американцев подала в суд на McDonald`s, требуя $100 млрд. Они заявляли, что гамбургеры вызывают привыкание. Нью-йоркский суд отклонил иск, аргументировав это тем, что нет закона, защищающего потребителей от их собственной невоздержанности.
В мае 2004 года в США вышел документальный фильм Моргана Сперлока "Двойная порция" (Super Size Me). Режиссер поставил на себе эксперимент — в течение 30 дней питался исключительно в McDonald`s. В итоге он поправился на 11 кг (плюс 13% к весу). Фильм стал хитом в США. После него сеть отказалась от продажи в своих ресторанах в США порции Supersize.
В мае 2004 года москвичка Ольга Кузнецова подала иск к компании, требуя 900 тыс. руб. Она облилась кофе, открывая тугую дверь ресторана. В 2006 году истица отказалась от иска. СМИ сообщали, что ресторан выплатил ей 125 тыс. руб. В 2012 году Тверской суд отклонил иск Общества защиты прав потребителей "Общественный контроль", требовавшего обнародовать ингредиенты продукции Mcdonald`s.
В апреле 2011 года британский шеф-повар Джейми Оливер в своем телешоу показал, что для гамбургеров сеть использует низкокачественное мясо, обработанное гидроксидом аммония для обеззараживания. После громкой кампании в СМИ компания отказалась от использования аммония.