Сформирована на базе 201-й мотострелковой дивизии, которая дислоцировалась в Таджикистане с осени 1945 года. В начале 1990-х годах в условиях гражданской войны в Таджикистане соединение осталось под юрисдикцией РФ. Сначала дивизия находилась в Таджикистане на основании подписанного в мае 1993 года договора о дружбе, сотрудничестве и взаимной помощи. В апреле 1999 года был заключен договор о статусе и условиях пребывания российской военной базы на таджикской территории. А 16 октября 2004 года подписано межправительственное соглашение о составе и организационно-штатной структуре базы. Таджикские власти вначале не настаивали на арендной плате за базу: долгое время РФ обещала им масштабные инвестиции (до $2 млрд в течение пяти лет). В сентябре 2009 года СМИ сообщили, что Таджикистан намерен пересмотреть условия договора и потребовать до $300 млн в год.
Командир базы — полковник Игорь Красин. Штатная численность — около 7 тыс. человек. Порядка 60-65% — контрактники. Вооружение — около 160 танков, около 300 бронемашин разных типов, артиллерийские системы и зенитно-ракетные комплексы. База подчинена Приволжско-Уральскому военному округу РФ.