Негосударственный пенсионный Инкомфонд зарегистрирован 13 декабря 1993 года как некоммерческая организация. Генеральным директором фонда является Тамара Задорожная, работавшая ранее в первом российском НПФ — Российском страховом пенсионном фонде — вместе с нынешним президентом Ассоциации НПФ Владимиром Никитиным.
Уставный фонд Инкомфонда — 30 млн руб. Учредители фонда — Инкомбанк, страховая компания ИВМА и АО "Зарубежцветмет", имеющие равные доли в капитале фонда. Управление активами фонда взял на себя Инкомбанк (Управление инвестиций).