Все банки, вступившие в систему страхования вкладов, обязаны вести ежедневный реестр вкладчиков. В случае отзыва лицензии у банка ЦБ вводит в него временную администрацию, которая в течение семи дней выявляет и идентифицирует реестр вкладчиков, после чего передает его в Агентство по страхованию вкладов (АСВ). Приняв реестр от временной администрации, агентство в течение семи дней направляет информацию о порядке приема заявлений от вкладчиков в "Вестник Банка России" и печатный орган по месту расположения банка (в случае с МБЭР — в газету "Московская правда"). В течение этих же семи дней АСВ для выплат пострадавшим вкладчикам выбирает аккредитованный при АСВ банк-агент (на сегодня это банк "Союз", Связьбанк и Импэксбанк). Как только вкладчик узнает о начале выплат, он может обращаться с заявлением в банк-агент и в течение трех дней может получить возмещение.
АСВ гарантирует выплаты каждому вкладчику одного банка до 100 тыс. рублей за вычетом встречных требований. Вклады на предъявителя, а также переданные банку в доверительное управление суммы под страховку не попадают. Суммы, превышающие 100 тыс. рублей, АСВ выплачивает позднее из конкурсной массы обанкротившегося банка.
Несмотря на то что АСВ может управиться с процедурными вопросами и быстрее, выплата по вкладам производится не раньше двух недель. Максимальный же срок, когда вкладчик имеет право на получение страхового возмещения, заканчивается после завершения конкурсного производства.
Однако возмещение может быть отодвинуто на неопределенный срок. Это может произойти в случае, когда пришедшая в банк временная администрация не обнаружит в нем реестра вкладчиков. Тогда администрация сама будет составлять реестр по заявлениям вкладчиков. Сколько времени может занять этот процесс, законодательно не установлено, а пока реестр не составлен и не передан в АСВ, агентство не может начать выплаты пострадавшим вкладчикам.