11 декабря 1994 года из Российской национальной библиотеки в Санкт-Петербурге были украдены 89 уникальных тибетских, китайских, монгольских, сирийских и западноевропейских манускриптов VI-XVIII веков (общая стоимость похищенного составила $100 млн). По этому делу был арестован и предстал перед судом Дмитрий Якубовский.
В сентябре 1995 года из той же библиотеки были украдены четыре тома первого издания альбома "Птицы Америки". Его стоимость превышает $1 млн. Тогда прокуратура Санкт-Петербурга возбудила уголовное дело в отношении директора библиотеки Академии наук РФ Валерия Леонова. Его обвинили в том, что в 1992 году он отправил в адрес французской фирмы "Русский библиофил" 54 книги, изданные в XVIII-XIX вв. Назад эти книги не вернулись, а были проданы Французской национальной библиотеке.
Рукописи из коллекций Государственной Ленинской библиотеки не раз появлялись на черном рынке Израиля и Европы. Последний такой случай зафиксирован в апреле 1996 года. И хотя ни одного уголовного дела по фактам хищения из "главной библиотеки страны" не было заведено, ФСБ не первый год пытается выяснить судьбу пропавших реликвий. В начале нынешнего года в Москве был задержан преступник, похитивший из бывшей библиотеки Института марксизма-ленинизма около 2,5 тыс. книг.