Эксперты ВШЭ порекомендовали прекратить или реформировать программу субсидирования авиаперевозок на Дальний Восток «ввиду ее экономической неэффективности». В расходах федерального бюджета на 2013–2020 годы на эту программу заложено около 25 млрд руб. Но такие расходы являются необоснованными, особенно с учетом того, что доступ к транспортной инфраструктуре есть у жителей Хабаровска, Владивостока и Благовещенска, говорится в документе. Эксперты считают, что у государства «нет необходимости субсидировать рейсы из Якутска в Геленджик и обратно в разгар летнего сезона», а население Дальнего Востока может выбрать альтернативные, менее дорогие с точки зрения транспортных издержек места для отдыха. В качестве альтернативы эксперты предложили субсидировать поездки в низкий зимний сезон или сохранить дотации отдельным группам граждан.
В качестве компенсаций выпадающих доходов авиакомпаний предлагается отменить НДС (18%) при покупке или лизинге самолетов. Отмена налога лишит бюджет $110–112 млн, но эту сумму компенсирует упразднение или реструктуризация субсидий. Эксперты также предложили субсидировать рейсы, а не количество пассажиров, а срок дотаций ограничить двумя годами. Если за это время маршрут не окупится, то государство должно прекратить помощь. По прогнозам Росавиации, в 2013 году программой субсидирования воспользуются более 520 тыс. пассажиров. В 2012 году в рамках программы перевезли 456,4 тыс. пассажиров.