Создано 19 февраля 1992 года при разделении Министерства экономики и финансов. Является федеральным органом исполнительной власти, отвечающим за выработку госполитики в бюджетной, налоговой, страховой, валютной, банковской и аудиторской сферах. Министерство также регулирует правила бухучета и бухгалтерской отчетности, контролирует производство, переработку и обращение драгоценных металлов и камней, контролирует формирование и инвестирование средств пенсионных накоплений, организацию и проведение лотерей. В ведении Минфина находятся выплаты внешнего и внутреннего долга РФ, регулирование таможенных платежей. Под управлением министерства — Резервный фонд и Фонд национального благосостояния. В структуру Минфина входят Федеральная налоговая служба, Федеральная служба финансово-бюджетного надзора и Федеральное казначейство.
Штатная численность центрального аппарата — 1421 человек. Расходы бюджета на деятельность центрального аппарата в 2012 году составят 3,45 млрд руб., в 2013 году — 3,29 млрд руб.