В апреле 2010 года по инициативе господина Фурсенко был разработан Кодекс чести российского футбола, который, как считалось, должен был искоренить все негативные явления в футбольном хозяйстве. Кодекс состоит из 12 пунктов, последний из которых завершается следующим пассажем: "В матчах сборной России (игрок.— "Ъ") демонстрирует высокий дух, патриотизм, полную отдачу; достойно несет звание гражданина великой страны и верит в победы". Впрочем, с соблюдением кодекса были некоторые сложности.
Практически одновременно с принятием Кодекса чести, также в апреле 2010 года, был учрежден комитет по этике, который возглавил экс-президент Чеченской Республики Алу Алханов. Предполагалось, что комитет будет противодействовать "странным" матчам в российском футболе и выносить решения по резонансным скандалам. На практике, однако, оказалось, что функции комитета по этике дублируются контрольно-дисциплинарным комитетом Российского футбольного союза (РФС). Более того, решения комитета неоднократно отменялись апелляционной инстанцией РФС. А летом 2011-го комитет был лишен права самостоятельно инициировать рассмотрение дел. Вместо этого ему было предложено рассматривать дела, направляемые РФС. Вскоре после этого господин Алханов свой пост покинул. За ним последовали и другие члены комитета, отмечавшие, что орган превратился в декоративный.
В июле 2010 года господин Фурсенко заявил, что российский чемпионат в целях "синхронизации с европейскими первенствами" нужно перевести на систему "осень-весна" вместо традиционно существовавшей системы "весна-осень". В сентябре того же года исполком РФС инициативу Сергея Фурсенко поддержал, невзирая на возражения о том, что российские климатические условия не подходят для игры в ноябре-декабре или ранней весной. Клубам, недовольным реформой, было предложено обзавестись крытыми манежами. В общей сложности затраты на приведение российского футбольного хозяйства в угодный президенту РФС вид оценивались в 9 млрд руб. На данный момент, после полуторагодичного чемпионата, переход к системе "осень-весна" завершен. Не исключено, впрочем, что теперь предстоит движение в обратном направлении.
В октябре 2010 года Сергей Фурсенко разорвал контракт с Профессиональной футбольной лигой (ПФЛ), проводившей чемпионаты страны в первом и втором дивизионах. Причиной стало несогласие президента ПФЛ Николая Толстых с переходом на систему "осень-весна". Господин Толстых, защищая свою позицию, принялся писать открытые письма президенту Медведеву и премьеру Путину. В итоге Сергей Фурсенко обратился в Минюст, который выяснил, что оказывается регистрация ПФЛ, состоявшаяся за 15 лет до того, была проведена незаконно. И последовал вывод о том, что все договоры с лигой "ничтожны". Права же на проведение турниров в первом и втором дивизионах были переданы учрежденной самим РФС Футбольной национальной лиге.
В июле 2011 года Сергей Фурсенко инициировал создание второй сборной России, в которой по его задумке обкатку должны были проходить "футболисты, которые переросли молодежную сборную, но пока не проходят в первую". Руководить командой был назначен Юрий Красножан. С тех пор сборная "Россия-2" провела пять матчей — с молодежной сборной России, дважды с олимпийской командой Белоруссии, со сборной Литвы и третьим составом сборной Англии.