Председателю ЦБ напрямую подчиняются шесть заместителей: Сергей Алексашенко, Андрей Козлов, Арнольд Войлуков (первые зампреды), Александр Хандруев, Вячеслав Соловов, Константин Лубенченко.
Сергей Алексашенко возглавляет блок денежно-кредитной политики. В этом направлении работают зампреды Татьяна Артемова (департамент методологии и организации расчетов), Александр Потемкин (департамент иностранных операций), Николай Егоров (департаменты информатизации и телекоммуникаций) и главный бухгалтер ЦБ Людмила Гуденко (департамент бухгалтерского учета и отчетности), должность которой приравнивается к рангу зампреда. Они подчиняются председателю через Сергея Алексашенко. Помимо перечисленных в блок денежно-кредитной политики входят департаменты организации и исполнения госбюджета и внебюджетных фондов, операций на открытом рынке, сводного экономического анализа. Все три напрямую подчиняются Сергею Алексашенко.
Андрей Козлов руководит направлением по банковскому надзору. Этот блок представлен Александром Турбановым (департаменты лицензирования банковской и аудиторской деятельности и по организации банковского санирования) и Денисом Киселевым (департаменты пруденциального банковского надзора и инспектирования кредитных организаций, ОПЕРУ-2). Они подчиняются Дубинину через своего непосредственного начальника. В блок банковского надзора также входят департаменты по контролю за деятельностью организаций на финансовых рынках и валютного регулирования и валютного контроля. Эти подразделения напрямую подчиняются руководителю блока Андрею Козлову.