| И | В | Н | П | М | 0 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. "Спартак" | 30 | 23 | 1 | 6 | 69:30 | 70 |
| 2. "Локомотив" | 30 | 18 | 8 | 4 | 50:20 | 62 |
| 3. "Торпедо" | 30 | 16 | 7 | 7 | 42:29 | 55 |
| 4. "Анжи" | 30 | 15 | 7 | 8 | 44:31 | 52 |
| 5. "Динамо" | 30 | 14 | 8 | 8 | 45:35 | 50 |
| 6. "Черноморец" | 30 | 13 | 10 | 7 | 47:28 | 49 |
| 7. "Зенит" | 30 | 13 | 8 | 9 | 38:26 | 47 |
| 8. ЦСКА | 30 | 12 | 5 | 13 | 45:39 | 41 |
| 9. "Сатурн" | 30 | 10 | 10 | 10 | 26:29 | 40 |
| 10. "Алания" | 30 | 10 | 8 | 12 | 34:36 | 38 |
| 11. "Ротор" | 30 | 8 | 8 | 14 | 35:54 | 32 |
| 12. "Ростсельмаш" | 30 | 6 | 14 | 10 | 24:27 | 32 |
| 13. "Факел" | 30 | 6 | 12 | 12 | 25:45 | 30 |
| 14. "Крылья Советов" | 30 | 8 | 5 | 17 | 25:45 | 29 |
| 15. "Локомотив" НН | 30 | 3 | 9 | 18 | 16:47 | 18 |
| 16. "Уралан" | 30 | 2 | 6 | 22 | 17:61 | 12 |
"Спартак" и "Локомотив" (Москва), "Торпедо", "Анжи" и "Динамо" выступят в Еврокубках в сезоне 2000/01; "Локомотив" (Нижний Новгород) и "Уралан" покидают высший дивизион.