25 марта 2010 года ФСФР признала факты манипулирования ценами акций компаний "Интертрейдинвест" и "Финкоминвест", совершенного инвесткомпанией "Профит-тайм". Предметом разбирательства стали сделки, совершенные в ноябре--декабре 2009 года. Акции были сняты с торгов, а "Профит-тайм" лишилась лицензии.
В декабре 2009 года первые торги акциями ВТБ дополнительного выпуска прошли с резким изменением цен (на 20-40%) по отношению к котировкам основного выпуска. Торги акциями нового выпуска были приостановлены до объединения его с основным выпуском. ФСФР начала расследование о возможных манипуляциях. В манипулировании никто обвинен не был.
С 16 по 20 октября 2009 года акции "Ростелекома" выросли на 30%. Компания обратилась в ФСФР проверить факты, сопровождающие этот рост, на предмет обнаружения признаков манипулирования. В январе 2010 года было объявлено, что операции были совершены "всем рынком" и отдельные покупатели "не прослеживались".
7 февраля 2008 года акции банка "Уралсиб" в течение нескольких минут подорожали на РТС более чем на 4%. Причиной взлета котировок стало сообщение на сайте ФСФР, из которого участники рынка сделали вывод, что банк купила АФК "Система". Сообщение было признано ФСФР "технической ошибкой", начато служебное расследование, но его результаты опубликованы не были.
В апреле 2008 года ФСФР установила, что четыре топ-менеджера ОАО "Ричброкерсервис" неоднократно манипулировали ценой обыкновенных акций ОАО путем совершения сделок с ними. ФСФР лишила компанию всех лицензий участника рынка ценных бумаг.
В ноябре 2007 года обвинения в манипулировании ценами на акции энергетической компании РИТЭК были предъявлены кипрской компании Palmaris Holding Limited. Офшор выступал покупателем и продавцом акций одновременно, за счет чего котировки РИТЭКа взлетели более чем на 30%. Несмотря на то что ФСФР признала факт манипулирования, наказания не последовало.
В декабре 2006 года — январе 2007 года котировки паев фонда "Пиоглобал — индекс ММВБ" существенно опередили рост индекса ММВБ, превзойдя оценочную стоимость пая в 10-40 раз. За месяц расследования в ФСФР выяснили, что сделки с паями совершались в интересах приблизительно 200 клиентов. При этом лишь в трех случаях были установлены факты совершения сделок одним и тем же клиентом через двух разных участников торгов. В манипулировании никто обвинен не был.
12 мая 2006 года в первый день торгов акциями "Полюс Золота" на ФБ ММВБ их котировки в пять раз превосходили котировки биржи РТС и внебиржевого рынка. Через месяц ФСФР объявила, что причиной заключения "экономически не обоснованных сделок" с этими ценными бумагами стало не манипулирование рынком, а техническая ошибка трейдеров.