О тяжелом положении ММКБ начали говорить в апреле 1994 года. Сначала обстреляли автомобиль председателя правления ММКБ Альберта Шалашова, и он заявил, что банк стремится поставить под контроль криминальные структуры. Через неделю после покушения вопрос о тяжелом финансовом состоянии Межрегионбанка обсуждался на очередном собрании пайщиков. До этого момента о проблемах одного из крупнейших банков России говорили вполголоса, и московские банки, ставшие его кредиторами, были неприятно удивлены, узнав, что долг ММКБ по межбанковским кредитам составляет более 1 трлн руб., и расплатиться со всеми долгами он не может.
Кредиторы заволновались. Некоторые обратились в суд с исковыми заявлениями, и в начале июня по определению Савеловского межмуниципального суда на корсчетах Межрегионбанка и его филиалов было арестовано 130 млрд руб., в том числе 120 млрд бюджетных средств. 5% от арестованной суммы (чуть более 6 млрд руб.) работники суда взяли себе в качестве вознаграждения, опираясь на постановление Совмина СССР, вышедшее еще в 1989 году. Из-за действий суда без денег остались клиенты банка — такие, как Кантемировская и Таманская дивизии, 16-я воздушная армия и спецназ МВД. Прокуратура Московской области признала определение суда противозаконным, а постановление Совмина СССР — антиконституционным, и в настоящее время Генпрокуратура готовит материалы для возбуждения уголовного дела.
Другие кредиторы создали специальную комиссию, руководить которой взялся глава банка "Хелп" Олег Харлампович. Тем временем представители "Фонда 50-летия Победы" выдвинули на пост председателя совета банка Иосифа Кобзона. Побыть банкиром певец не успел: учредители консорциума "Экология России", одного из пайщиков ММКБ, стали и учредителями Межрегионбанка, внеся в его уставный фонд 73 млрд руб., а председателем совета банка стал Иван Силаев. Из старого руководства осталось несколько человек во главе с председателем правления Альбертом Шалашовым. Это почему-то не понравилось и. о. председателя Центробанка Татьяне Парамоновой, которая подписала приказ о назначении в ММКБ временной администрации, но отложила свое решение до 1 сентября.
В ММКБ была создана комиссия, которая занялась расследованием причин тяжелого финансового положения банка. Ее возглавил помощник председателя совета банка Евгений Федотов. Деятельность его комиссии поставили под контроль российские спецслужбы.