25 ноября 1997 года УФСБ Ростовской области задержало вблизи секретных объектов Ростова-на-Дону и Батайска сотрудника компании Qualcomm Inc. Ричарда Блисса. Инженер принимал участие в установке и испытаниях сотовой системы для компании ОАО «Электросвязь Ростовской области» и проводил топографо-геодезические работы, которые, по закону, запрещены без санкции ФСБ. Сотрудника Qualcomm Inc. обвинили в шпионаже. 6 декабря 1997 года он был освобожден под подписку о невыезде, а затем отпущен в США на рождественские праздники и в России больше не появлялся.
8 июля 1999 года сотрудники Воронежского УФСБ по обвинению в промышленном шпионаже выдворили из страны американскую стажерку Воронежского госуниверситета Джастин Гамильтон. При обыске у нее была обнаружена секретная экологическая карта Воронежской области.
4 апреля 2000 года американский бизнесмен Эдмонд Поуп был задержан в Москве при получении ТТХ противолодочной торпеды «Шквал» от профессора МГТУ имени Баумана Анатолия Бабкина. В декабре 2000 года Поуп был осужден Мосгорсудом на 20 лет строгого режима за шпионаж. В том же году президент России Владимир Путин помиловал американца, который, как сообщалось, был болен раком. Профессор Бабкин получил восемь лет условно.
27 февраля 2001 года ФСБ заявила о разоблачении американского разведчика Джона Эдварда Тоббина. 24-летний американец, стажировавшийся в Воронежском госуниверситете, был задержан в одном из городских кафе с полутора граммами марихуаны. В апреле 2001 года Ленинский райсуд Воронежа осудил Тоббина за хранение наркотиков на 3 года и один месяц тюрьмы. Позже срок сократили, а в августе американец был освобожден условно-досрочно и вернулся на родину. Российские спецслужбы установили, что он прошел подготовку в военно-разведывательной школе Хуачука (штат Нью-Мексико) и, вероятно, приезжал в Россию на «обкатку» перед серьезным заданием.
10 апреля 2002 года российские контрразведчики объявили о пресечении деятельности оперативников ЦРУ Дэвида Робертсона и Юнджу Кенсинджер, работавшей в должности 3-го секретаря консульского отдела американского посольства в Москве. По данным ФСБ, они вступили в контакт с неназванным подполковником, работавшим в испытательном центре вооружений ВМФ Минобороны РФ на озере Иссык-Куль, где проводились испытания российской торпеды «Шквал». Офицер рассказал об этом контрразведке. Госпоже Кенсинджер, обладавшей дипломатическим иммунитетом, контрразведчики не стали предъявлять претензий, и она беспрепятственно вылетела на родину. Господину Робертсону, который находился в Киргизии, также удалось избежать проблем с ФСБ.