30 октября 1991 г. на 5-м Съезде народных депутатов РСФСР был избран первый состав Конституционного суда РСФСР из 13 судей. Так впервые в истории России был образован судебный орган конституционного контроля, главным направлением деятельности которого стала защита прав и свобод граждан.
С момента образования в КС России поступило свыше 105 тыс. обращений граждан, их объединений и государственных органов. На публичных заседаниях Конституционным судом рассмотрено 188 дел. Кроме того, КС проверил 150 законов и других нормативных актов федерального уровня и 45 нормативных актов в субъектах Федерации на соответствие их Конституции РФ. Из них лишь 28 федеральных правовых актов и 5 нормативных актов субъектов Федерации были признаны конституционными полностью или частично.Главными направлениями деятельности КС стали защита конституционных прав и свобод граждан, а также толкование Конституции РФ. По этой категории дел КС за время своего существования принял 100 постановлений, (свыше 62% от их общего числа).
В частности, в законодательном порядке был защищен конституционный принцип равенства граждан перед законом и судом, право на судебную защиту, права потерпевших от злоупотреблений властью, трудовые, жилищные, пенсионные права, права в налоговых правоотношениях, право на свободу передвижения и выбор места жительства.
23 июля 1994 г. вступил в силу Федеральный конституционный закон "О Конституционном суде Российской Федерации". Общее число судей Конституционного суда было увеличено до 19, созданы две палаты КС. Из компетенции суда была исключена проверка конституционности политических партий и других общественных объединений, а также правоприменительной практики. На Конституционный суд были возложены такие полномочия, как дача общеобязательного толкования Конституции РФ, предусмотрена возможность установления дополнительных полномочий Конституционного суда.
Изменениями и дополнениями от 8 февраля 2001 г. в закон "О Конституционном суде Российской Федерации" были сняты возрастные ограничения для судей КС, а срок полномочий его членов увеличился с 12 до 15 лет (ранее судья КС назначался на 12 лет при предельном возрасте 70 лет).
Конституционный суд действует на основании статьи 123 Конституции РФ, Федерального конституционного закона "О Конституционном суде Российской Федерации" и Регламента КС РФ, принятого 1 марта 1995 г.
Первым председателем КС стал Валерий Зорькин. С 1995 по 1997 гг. председателем КС был Владимир Туманов. С 20 февраля 1997 г. и по настоящее время Конституционный суд возглавляет Марат Баглай.