С 26 августа 1999 года Герман Греф входит в состав совета директоров ОАО "Газпром", с июля 2006 года возглавляет комитет компании по оценке. 30 июня 2000 года избран в состав совета директоров РАО "ЕЭС России". В настоящее время также входит в советы еще двух энергетических компаний: ОАО "Федеральная сетевая компания ЕЭС" (с января 2002 года) и ОАО "Системный оператор--Центральное диспетчерское управление ЕЭС" (с августа 2003 года). С 8 декабря 2006 года господин Греф является председателем совета директоров Российской венчурной компании. С 2000 года является директором от России Европейского банка реконструкции и развития, с июня 2005 года — член наблюдательного совета Сбербанка.