Основано в апреле 2001 года как Межрегиональный банк развития предпринимательства (переименован в июне 2002 года). С 2002 года является стратегическим партнером казахстанского Казкоммерцбанка в России. С июля 2007 года Казкоммерцбанк владеет 52,11% уставного капитала Москоммерцбанка. Банк имеет семь филиалов в России — в Москве, Санкт-Петербурге, Волгограде, Калининграде, Новосибирске, Челябинске, Нижнем Новгороде. Собственный капитал банка — 3,39 млрд руб. (72-е место в стране), чистые активы — 40,99 млрд руб. (48-е место). Стратегическое направление развития Москоммерцбанка — розничный бизнес. По состоянию на 27 августа 2007 года кредитный портфель банка по МСФО составил $1,663 млрд, из них розничные кредиты, прежде всего ипотечные,— $1,301 млрд.