10 июля власти Пакистана решились на штурм Красной мечети (Лал Масджид) в Исламабаде. По официальным данным, в ходе штурма погибли 50 боевиков и 8 солдат Пакистана, 15 человек получили ранения. Пакистанские военные не обнаружили в Красной мечети ни детей, ни женщин, об удержании которых в качестве заложников говорили боевики. К 8 часам утра по местному времени правительственные войска взяли под контроль около 70% территории Лал Масджид.
Конфликт между исламистами, базирующимися на территории Красной мечети, и властями Пакистана перешел в решающую стадию после попытки покушения на президента Первеза Мушаррафа 6 июля. Президент Пакистана после обстрела его самолета исламистами заявил о готовности пойти на самые жесткие меры решения конфликта: «Те, кто находится внутри Лал Масджид, должны сдаться, в противном случае они будут убиты».
Во время переговоров известных пакистанских богословов с лидером исламистов, оккупировавших мечеть, Абдулом Рашидом Гази последний отказался капитулировать и выдвинул ряд неприемлемых условий. В том числе он заявил, что предпочитает «пойти на самопожертвование, которое может послужить толчком к исламской революции», чем сдаться. По его утверждению, на территории Лал Масджид находились 2 тыс. его сторонников, однако по данным сил безопасности, в мечети было не более 500 студентов-исламистов, а также женщины и дети, которых боевики удерживали в качестве заложников и намеревались использовать в качестве живого щита.
После провала переговоров 10 июля в 4 часа утра по местному времени началась операция по штурму мечети под кодовым названием «Тишина». После подготовительных взрывов территория Лал Маджид была атакована с трех сторон. Центром боев стало северное крыло примыкающего к мечети женского медресе Джамия Хафса. «Медресе — это большая территория, около 75 комнат плюс подвалы. Мы шаг за шагом продвигаемся вперед», — сообщили военные. 20 детей и подростков, насильно удерживавшихся исламистами в мечети, смогли освободиться и перебежать к позициям армии. К 8 часам утра по местному времени правительственные войска взяли под контроль около 70% территории мечети и медресе. По словам официального представителя армии Пакистана Вахида Аршада, к этому времени боевики продолжали удерживать подвальные помещения, а также помещения для прислуги. Одно из подвальных помещений занял лидер исламистов Абдул Рашид Гази. Боевики использовали огнестрельное оружие, гранаты, бутылки с зажигательной смесью. Вахид Аршад заявил, что боевики «оказывают отчаянное вооруженное сопротивление, идет интенсивная перестрелка». Часть исламистов обстреливали территорию Лал Масджид с минаретов. По разным оценкам, в подвалах могли быть примерно 150 человек, значительную часть которых составляли женщины и подростки.
Военные высказали предположение о том, что исламисты заминировали помещения медресе.
По официальным данным, в ходе операции погибли 50 боевиков и 8 солдат пакистанской армии, 15 человек получили ранения. По словам пакистанского военного, 60 боевиков сдались после того, как им предоставили последнюю возможность это сделать. Во время штурма мечеть покинули 27 студентов и 20 женщин.