Одной из серьезных проблем, тормозящих ускоренное развитие электронных систем расчетов, является практически полное отсутствие законодательства в этой области. Правда, проблему законности этих операций сегодня активно пытается решить ЦБ. Одним из важных результатов, достигнутых ЦБ в рамках выполнения программы по автоматизации расчетов, является принятие стандарта электронной подписи, унифицирующего разработки отечественных программистов. Однако все эти попытки относятся к сфере взаимоотношений между коммерческими банками и расчетно-кассовыми центрами ЦБ. Что же касается урегулирования вопросов взаимодействия банков и их клиентов, то в этом отношении по-прежнему единственно законным финансовым документом считается бумажный, имеющий стандартную печать и подписи руководителей организации. В результате налоговые инспекции и другие государственные органы электронный документооборот официально не признают.
Для решения этой проблемы банки используют два основных варианта. По первому за клиентом сохраняется обязанность предоставлять в обслуживающий его банк за определенный период времени (скажем, за месяц) те же самые бумажные платежки. Только не в пяти экземплярах, как обычно, а всего лишь в двух. Иногда клиенту разрешается предоставлять сразу целый реестр платежек, который заверяется подписями и печатями с обеих сторон. Такая форма взаимоотношений с клиентами существует, например, в Инкомбанке и Нефтехимбанке. В другом случае клиент подписывает с банком договор о признании законности электронно-цифровой подписи. А бумажные документы доставляются им в банк только в том случае, если по каким-либо причинам ему необходимы стандартные платежные документы. По такому пути пошел, например, Кредобанк.