В 2002 году на базе дочерней структуры "Рособоронэкспорта" ОАО "ОПК 'Оборонпром'" началось формирование вертолетостроительного холдинга. Сейчас в него входят Московский вертолетный завод имени Миля, Улан-Удэнский авиационный, Казанский вертолетный заводы, компания "Роствертол" (Ростовский вертолетный завод), ОАО "Камов" (КБ имени Камова, к которому в ближайшее время должны присоединиться Кумертауский вертолетный и Арсеньевский авиастроительный заводы), Московский машиностроительный завод "Вперед" и Ступинское машиностроительное производственное предприятие.
В начале 2007 года "Рособоронэкспорт" зарегистрировал ОАО "Сатурн", на базе которого должна пройти консолидация активов в двигателестроении. Ведутся переговоры о вхождении в новый холдинг НПО "Сатурн", Пермского моторостроительного комплекса и Уфимского моторостроительного производственного объединения.
В 2005 году компания занялась автомобилестроением: за $700 млн куплены 61,8% ОАО АвтоВАЗ, управленцы ФГУПа заняли ключевые позиции в компании.
В январе 2006 года ФГУП на паритетных началах с ЗАО "НПО 'Авиатехнология'" учредило ООО "АТ-Спецтехнология" с целью создания металлургического холдинга. К концу 2006 года компания за $700 млн выкупила 66% акций производителя титана ОАО "Корпорация 'ВСМПО-Ависма'". В январе 2007 года через холдинг "Русспецсталь" приобретен завод "Красный Октябрь" и начато формирование госмонополии по выпуску спецсталей.
В 2005 году при участии ФГУПа был создан фонд "Спорт", занимающийся поддержкой российского спорта и девелоперской деятельностью в подмосковном Зеленограде.