В 1993 году по указу президента Башкирии было создано ОАО "Башкирская нефтехимическая компания" ("Башнефтехим"), в уставный капитал которого внесли госпакеты акций Уфимского НПЗ (74,9%), Ново-Уфимского НПЗ (85,4%), "Уфанефтехима" (60,6%), "Уфаоргсинтеза" (71,8%) и "Башкирнефтепродукта" (57,4%). В 1999 году "Башнефтехим" влился в ОАО "Башкирская топливная компания" (БТК), куда правительство Башкирии передало также госпакеты "Башнефти" (63,7%) и "Башкирэнерго" (32%). В 2003 году "Башнефтехим" и БТК продали по льготной цене все принадлежавшие им госпакеты семи частным ООО: ("Таймас", "Соцсервис", "Щит", АТП-99, "Нефтехимтранс", "Химспецтранс" и предприятию механизации и транспорта нефтепереработки). Эти ООО в том же году учредили "Башкирский капитал", внеся в его уставный капитал в виде паев принадлежавшие им акции. Позже паи выкупили сами предприятия ТЭК. Эту схему перекрестного владения изменили в 2006 году, после того как в августе 2005 года АФК "Система" купила у "Башкирского капитала" блокпакеты акций предприятий. Тогда контрольные пакеты акций с башкирской компании были переведены на четыре частных благотворительных фонда, позже преобразованных в частные инвесткомпании ("Урал-Инвест", "Агидель-Инвест", "Инзер-Инвест" и "Юрюзань-Инвест").