18 февраля саудовская газета "Аш-Шарк аль-Аусат" сообщила, что в Дубае (ОАЭ) по просьбе властей Катара задержаны три человека "европейской наружности".
26 февраля власти Катара подтвердили информацию об аресте и сообщили, что задержанные — граждане России. И. о. главы МИД РФ Игорь Иванов выразил протест послу Катара в Москве. Он признал, что задержанные — сотрудники спецслужб РФ, которые прибыли в Катар, чтобы заниматься "информационно-аналитической работой для борьбы с международным терроризмом", но подчеркнул, что к убийству Яндарбиева Россия "отношения не имеет". Глава департамента Ближнего Востока МИД РФ Михаил Богданов на встрече с главой МИД Катара в Дохе добился освобождения задержанного первого секретаря посольства Александра Фетисова (без права покидать Катар). Вечером того же дня в Шереметьево-2 в Москве за незаконный провоз валюты были задержаны гражданин Катара азербайджанского происхождения, член сборной эмирата по греко-римской борьбе Ибад Ахмедов, его тренер гражданин Белоруссии Александр Дубровский и член совета Национальной федерации борьбы Катара Насер Ибрагим Мидахи.5 марта западные СМИ со ссылкой на диписточники сообщили, что россияне в Катаре признались в убийстве.
19 марта Ъ сообщил, что задержанные в Шереметьево переданы ФСБ МИДу. ЦОС ФСБ признал факт ареста и сообщил, что азербайджанец и катарец находятся в СИЗО "Лефортово".
В ночь на 24 марта Владимир Путин говорил по телефону с эмиром Катара шейхом Хамадом бен Халифой аль-Тани, после чего катарцев отпустили из СИЗО, Александр Фетисов покинул Катар.
6 апреля дело россиян в Катаре передано в суд.
11 апреля на первом заседании суда впервые оглашены имена россиян (Анатолий Белашков и Василий Бокчов), зачитаны пункты обвинения. Россияне вину не признали.
12 апреля катарская газета Al-Raya обвинила в организации убийства министра обороны РФ Сергея Иванова.
18 апреля телеканал Al Jazeera сообщил о договоренности РФ и Катара: после приговора россиян помилуют.
25 апреля процесс объявлен закрытым. Допрошен первый свидетель обвинения. Адвокаты заявили, что признания подсудимых получены под пытками.
26 апреля показания в суде дала вдова экс-президента Ичкерии Малика Яндарбиева.
28 апреля в вызванном в суд обвинением сотруднике местных спецслужб подсудимые узнали пытавшего их человека.
2 мая в суде показана видеозапись следственного эксперимента: обвиняемые рассказывают о подготовке убийства.
5-6 мая россияне заявили о пытках в ходе следствия и отказались отвечать на вопросы обвинения.
30 мая и. о. гендиректора НТВ Александр Герасимов распорядился снять из программы "Намедни" интервью с вдовой Зелимхана Яндарбиева "по просьбе спецслужб". Автор и ведущий "Намедни" Леонид Парфенов придал этот факт огласке, после чего был уволен с канала.
8 июня прокуратура Катара объявила вину россиян доказанной и потребовала для них смертной казни. Суд назначил оглашение приговора на 30 июня и удалился на совещание.