Образован в январе 2011 года на базе Следственного комитета при прокуратуре РФ (2007–2010). Является федеральным государственным органом, наделенным полномочиями в сфере уголовного судопроизводства, включая доследственную проверку, криминалистическое сопровождение, предварительное следствие, процессуальный контроль.
В структуру СК входят центральный аппарат, территориальные органы, включая специализированные и военные, а также образовательные учреждения и научные организации. Председатель и его заместители назначаются указом президента РФ. В Следственном комитете служит более 23 тыс. сотрудников (в том числе военные следователи).
В 2019 году было расследовано и направлено в суды почти 97 тыс. уголовных дел в отношении 107 тыс. обвиняемых. Потерпевшим возмещено более 48,5 млрд руб., наложен арест на имущество подозреваемых и обвиняемых стоимостью 55,3 млрд руб. За год СКР возбудил свыше 18 тыс. уголовных дел о коррупционных преступлениях.