ОАО «Аэропорт Курган» по итогам 2016 года получило чистый убыток 13,7 млн руб. против 3,3 млн руб. прибыли годом ранее. Выручка предприятия в 2016 году превысила 130,5 млн руб., что на 14,8% больше показателя 2015 года (113,6 млн руб.). Согласно годовому отчету компании, объем перевозок пассажиров из аэропорта Кургана в 2016 году составил 67,4 тыс. человек (90,2% к уровню 2015 года). По направлению Курган—Москва—Курган были перевезены 62,7 тыс. человек (89,8% к уровню предыдущего года). Снижение пассажиропотока связывают с отменой с 1 сентября 2015 года рейсов авиакомпанией «Трансаэро». В 2016 году также было выполнено десять рейсов на Сочи и столько же на Симферополь. Руководство порта сейчас ведет переговоры с авиакомпаниями о выполнении в 2017 году полетов в Санкт-Петербург и открытии полетов в Москву в вечернее время. После завершения работ по проектированию начнется реконструкция аэровокзала, что позволит привести его в соответствие международным требованиям и впоследствии запустить международные рейсы.