Временно исполняющий обязанности главы Калининградской области Николай Цуканов о причинах выдвижения кандидатуры Якунина именно от этого региона: «Владимир Иванович Якунин является давнишним другом Калининградской области. Ни для кого не секрет, что железная дорога — это в прямом смысле дорога жизни. Основные грузы, которые поступают на территорию и с территории, — это железная дорога, поэтому мы неоднократно взаимодействовали по решению проблем. Допустим, таких, как дополнительный железнодорожный порог, который необходимо было отправить в наш регион, скоростной поезд Москва — Калининград по сокращению времени пути, субсидирование ж/д-перевозок и масса других вопросов. Мы встречались, разговаривали неоднократно с Владимиром Ивановичем. Когда появилась такая возможность обсудить вопрос представлять регион, Владимир Иванович подтвердил свою готовность. Согласно действующему законодательству губернатор должен предоставить список из трех кандидатов в сенаторы, что я и сделал. Три кандидатуры представлены избирательной комиссии. Избирательная комиссия рассматривает документ».
О бывшем главе РЖД: «У меня самые лучшие впечатления о Владимире Ивановиче. По крайней мере, когда речь шла о Калининградской области, он с пониманием относился к проблемам транспортной безопасности и давал не только свое экспертное заключение, но и выражал восхищение на рабочих комиссиях, комиссиях, которые возглавлял Дмитрий Медведев. Это профессионал, на мой взгляд, который очень качественно выполнял свою работу».
Политолог Станислав Белковский об отставке Владимира Якунина: «У Владимира Якунина много противников на самых разных уровнях. Постановление об его отставке два года назад появилось неслучайно. Но тогда Владимир Путин остановил это решение, формально принятое кабинетом Дмитрия Медведева. В числе его преемников уже тогда назывался помощник президента Игорь Левитин, вице-президент РЖД по высокоскоростному сообщению Александр Мишарин, генеральный директор "Уралвагонзавода" Олег Сиенко. Логика развития событий была предопределена еще тогда».
О качестве и результатах работы Якунина: «Вообще, в нынешней системе власти менеджерские качества имеют второстепенное значение. На первом месте стоит лояльность, а на втором месте — компромиссный характер той или иной кандидатуры. Качество работы гигантской корпорации не является решающим фактором для кадровых назначений. И у "Газпрома" тоже все нездорово, но Алексей Миллер до сих пор остается на своем пост, и у "Роснефти" падает добыча, и что? Сами по себе менеджерские качества Якунина не могли привести к отставке. К этому привел именно широкий альянс его оппонентов. Определенные достижения у Якунина были, но принципиального рывка не произошло».