В итоге двухмесячных переговоров между администрацией президента, правительством и отраслевыми лоббистами законопроект о ФКС получился более стройным, внятным и компромиссным. Бюджетным учреждениям разрешили не проводить по нормам ФКС те закупки, средства на которые они заработали сами. Был выработан компромиссный механизм действий в случаях, когда закупочная процедура не состоялась. В прежней версии, как и в ФЗ-94, закупщик мог заключать контракт с единственным поставщиком, согласовав это с ФАС. Теперь в случаях, когда в процедуре не участвовало ни одного поставщика, закупщик обязан провести повторную процедуру (для конкурсов возможно также снижение цены в пределах 10%). Если и та не вызовет интереса, закупщик может прибегнуть к запросу предложений (наиболее свободная форма закупки). В духе первого чтения были изменены и правила участия в двухэтапных конкурсах. Такая форма используется, когда закупщик на первом этапе обозначает проблему и просит участников предложить различные способы ее решения. Теперь во втором этапе конкурса, когда нужно подавать уже конкретные предложения с ценой, смогут участвовать только участники первого этапа. Впервые введены пени для операторов электронных площадок за задержку разблокирования и возвращения обеспечения — 1/300 от базовой ставки ЦБ в день. Также впервые в законопроекте закреплено исключительное положение «Росатома», который имеет полномочия федерального органа власти и может издавать нормативные акты в сфере закупок, сам являясь при этом закупщиком.