Ведет свою историю от ЗАО "Расчетная палата ММВБ", учрежденного в 1996 году биржей ММВБ, шестью региональными валютными биржами и рядом банков. Нынешнее название получил в июне 2010 года после слияния с ЗАО "Национальный депозитарный центр". Имеет статус небанковской коммерческой организации. Оказывает услуги по хранению, учету и переходу прав на ценные бумаги путем открытия и ведения счетов депо, обслуживает биржевые и внебиржевые сделки со всеми видами бумаг российских эмитентов, осуществляет расчеты по сделкам участников финансового рынка, а также присваивает ценным бумагам международные коды ISIN и CFI. В октябре 2011 года стал основным претендентом на получение статуса центрального депозитария России. В 2011 году обороты по банковским счетам клиентов Национального резервного депозитария и оборот по ценным бумагам составили 239,6 трлн руб. и 95,9 трлн руб. соответственно. На обслуживании находятся ценные бумаги общей стоимостью 8,3 трлн руб., в том числе акции "Газпрома", "Роснефти", МТС и "Ростелекома". Крупнейшим акционером депозитария с пакетом в 99,96% является ОАО ММВБ-РТС. Операционная прибыль в 2011 году составила 2,9 млрд руб. Штат — около 400 человек.