9 июня 2002 года после завершения трансляции футбольного матча Россия—Япония толпа хулиганов учинила погром на Манежной площади в центре Москвы. Всего на площади присутствовало более 8 тыс. болельщиков. В результате было разбито 227 витрин и повреждено около 80 автомобилей. Вскоре после начала погромов на место прибыли 433 военнослужащих дивизии внутренних войск, около 10 из них в результате столкновений получили ранения.
С 2006 года военнослужащие регулярно привлекаются для сопровождения несанкционированных «Русских маршей» в Москве. В 2007 и 2008 годах СМИ сообщали о «десятках грузовых "Уралов" с бойцами внутренних войск», припаркованных недалеко от места проведения акции, но об участии военнослужащих в задержаниях националистов не сообщалось.
В апреле 2010 года военнослужащие были срочно направлены на обеспечение безопасности московского метро после терактов 29 марта, которые унесли жизни 39 человек. Сообщалось, что для дежурства на станциях, в подземных переходах и на прилегающих к объектам метро территориях задействовано до 1 тыс. военнослужащих.
11 декабря 2010 года несанкционированный митинг на Манежной площади, посвященный гибели болельщика «Спартака» Егора Свиридова в драке с кавказцами, перерос в погромы и столкновения с милицией. В акции, по разным данным, приняли участие от пяти до 20 тыс. человек. После начала беспорядков на подмогу ОМОНу приехало более десяти грузовиков с солдатами внутренних войск МВД. В результате столкновений пострадали более 10 человек, несколько десятков фанатов были задержаны. 15 декабря того же года военнослужащие внутренних войск несколько часов дежурили на Киевской площади у торгового центра «Европейский», однако намечавшаяся там новая массовая акция протеста националистов так и не состоялась.