Конфликт производителя апатитового концентрата ОАО "Апатит" (входит в холдинг "Фосагро") и производителя удобрений ОАО "Акрон" начался в декабре 2002 года. "Акрон" заявил, что поставщик отказывается от заключения прямых контрактов, что увеличивает цену в два раза. "Апатит" объявил неприемлемым предложенный контрагентом контракт на десять лет с фиксированной ценой. За "Акрон" заступился ряд губернаторов, пожаловавшихся в Министерство по антимонопольной политике. Ведомство не нашло в действиях "Апатита" нарушений. В итоге стороны стали заключать прямые контракты на год.
В сентябре 2005 года "Акрон" через Мосарбитраж потребовал обязать "Апатит" заключить пятилетний договор на четко оговоренных ценовых условиях. 9 июля 2006 года суд удовлетворил это заявление, установив цену на сырье в 1600 руб. за тонну. 13 июля 2007 года "Фосагро" потребовал в Мосарбитраже повысить цену до 1822 руб. в связи с изменением рыночной конъюнктуры. Первая инстанция подтвердила правоту холдинга, но 9-й арбитражный апелляционный суд отменил это решение. Тогда "Фосагро" пригрозил расторжением контракта, и в марте 2008 года "Акрон" сам предложил повышение до 2232 руб. за тонну.
В августе 2008 года аналогичный конфликт возник у "Апатита" с ОАО "Воскресенские минеральные удобрения" (ВМУ, входит в холдинг "Уралхим"), предложившим фиксированную цену на 2009-2011 годы. "Апатит" отказался, и ВМУ обратилось в Мосарбитраж. В одном иске компания настаивала на заключении упомянутого контракта. Этот иск одобрили все инстанции. В другом предприятие требовало вернуть 1,997 млрд руб., утверждая, что "Апатит" навязал невыгодный контракт в 2008 году. 18 мая этот иск удовлетворил Мосарбитраж. 16 октября 2009 года гендиректор "Фосагро" Максим Волков в письме вице-премьеру Игорю Сечину пожаловался на контрагента. Чиновник распорядился решить проблему, но указал частным акционерам "Фосагро" на "недопустимость шантажирования правительства". 2 февраля 2010 года Высший арбитражный суд отменил решение о взыскании с "Апатита" 1,997 млрд руб.