У НФС и его коммерческих партнеров возникли проблемы не только с правоохранительными органами, но и с криминальными структурами. На слуху по меньшей мере два убийства, так или иначе связанных с фондом. Они были совершены в прошлом году.
В конце марта из автомата застрелили ведущего эксперта дирекции внешнеэкономической деятельности НФС Льва Гаврилина. Сотрудники фонда связали происшедшее с указом президента России "О признании утратившими силу и об отмене решений президента в части предоставления таможенных льгот", который был подписан 8 марта. Заместитель генерального директора НФС Петр Васильев заявил, что эти льготы позволяли весьма эффективно распоряжаться заемными средствами. Поэтому фонд активно привлекал их, причем они оформлялись не только как кредиты, но и как различные инвестиционные договоры. После отмены льгот НФС оказался не в состоянии выполнить свои обязательства перед инвесторами. Так, превысили возможности фонда расходы на Игры доброй воли, организацией которых занимался Лев Гаврилин. НФС взял много кредитов в банках на проведение турнира и спортивных лотерей. После отмены налоговых льгот лотереи, по словам Васильева, стали менее прибыльными, и фонд оказался не в состоянии расплатиться по некоторым обязательствам. Лев Гаврилин был посредником между инвесторами, и НФС и ему пришлось объясняться с кредиторами. К чему это привело, известно.
В декабре того же года был похищен и убит один из партнеров НФС, основатель небезызвестной фирмы "Русская Америка" Марк Нудель, который первым в России начал торговать "Кремлевской" и "Белым орлом". Бандиты, представившиеся охранникам Нуделя агентами ФСБ, увезли его из аэропорта "Шереметьево-2" в неизвестном направлении, после чего потребовали перевести на счет некоторой немецкой фирмы DM3 млн. Деньги ушли в Германию, оттуда на Кипр. Нудель же был убит, и тело его брошено в Москву-реку.