Кроме статей о спецслужбах, политически вредными были признаны исследования Леонида Паршина творчества Михаила Булгакова. Результатом этих работ были многочисленные статьи в журналах, публикация воспоминаний первой жены Булгакова и статья "Чертовщина в американском посольстве в Москве". Паршин выдвинул гипотезу, что у событий, описанных в романе "Мастер и Маргарита", была реальная основа. По его мнению, прототипом бала Сатаны послужил прием в американском посольстве, куда были приглашены Булгаков с женой. Барон Штайгер в действительности был двойным агентом НКВД и американского управления стратегических служб (ныне ЦРУ) и был разоблачен в Москве. И реплика Ивана Бездомного, брошенная в "Грибоедове", "Вульф ни в чем не виноват...", по мнению Паршина, в романе появилась не случайно. Некий Вульф, директор ленинградского Красного театра, был арестован, а возглавляемый им театр сгорел. Сейчас к выходу в свет готовится книга Леонида Паршина "Булгаков и его герои глазами компьютера".
Паршин также является и основателем московского Института прикладной психологии.