Елена Суворова работает в системе налоговых органов с 2003 г., когда стала налоговым инспектором межрайонной ИМНС России № 38 по Москве.
С 2004 г. работала главным государственным налоговым инспектором, заместителем начальника отдела Межрайонной ИФНС России № 47 по Москве.
С 2006 г. - заместитель начальника отдела УФНС России по Москве.
С июля 2010 г. - заместитель начальника управления Министерства обороны.
В декабре 2010 г. назначена заместителем начальника управления - начальником отдела рассмотрения судебных споров с налогоплательщиками Москвы и Московской области правового управления ФНС.
С июля 2011 года возглавляет Управление досудебного урегулирования налоговых споров.