6 января 1994 года правительство РФ одобрило постановление "О строительстве комплекса зданий парламентского центра" на месте стадиона "Красная Пресня" в Москве. Несогласие с решением о строительстве центра за $500 млн стало одной из причин отставки первого вице-премьера Егора Гайдара. 24 января Борис Ельцин своим указом приостановил вступление в силу постановления кабинета.
В апреле 1998 года Борис Ельцин на встрече со спикером Госдумы Геннадием Селезневым пообещал ему решить проблемы депутатов, построив для них парламентский центр. За четыре дня до дефолта управделами президента предложило выпустить внешний заем на $2 млрд для финансирования строительства, но из-за кризиса планы реализованы не были.
В марте 2000 года Геннадий Селезнев предложил перенести обе палаты парламента в Санкт-Петербург. Проект поддержал губернатор Владимир Яковлев, предлагавший выстроить комплекс напротив Таврического дворца или на Васильевском острове. Идея не нашла понимания у депутатов, и разговоры о переезде вскоре утихли.
24 мая 2000 года на открытии выставки Realtex 2000 мэр Москвы Юрий Лужков предложил построить парламентский центр на территории "Москва-Сити". В качестве альтернативных вариантов мэрия предлагала участок на Кутузовском проспекте за панорамой "Бородинская битва" и Поклонную гору. Предложения не нашли поддержки депутатов и управделами президента.
26 августа 2006 года правительство РФ распорядилось спроектировать парламентский центр на месте стадиона "Красная Пресня". Однако под давлением местных жителей, выступивших в защиту стадиона, и Мосгордумы, принявшей специальное обращение к правительству, от проекта отказались.
27 апреля 2010 года управделами президента РФ Владимир Кожин сообщил, что центр будет строиться в "центральной части Москвы, внутри Садового кольца". Позднее стало известно, что власти Москвы обсуждают строительство центра на месте бывшей гостиницы "Россия", но в январе 2012 года премьер Владимир Путин отверг эту идею.
С апреля 2012 года обсуждалась возможность перемещения парламента на территорию Новой Москвы. Переезду противилась Госдума, а управделами президента не исключало строительство парламентского центра рядом с Кремлем.