В июне 2005 года инспекция ФНС по Ломоносовскому району Ленинградской области приняла решение не возвращать ЗАО "Филип Моррис Ижора" (принадлежит американской Philip Morris International) переплату налога на прибыль в размере 441 млн руб. Компании потребовалось несколько месяцев, чтобы добиться отмены этого решения в арбитражных судах.
В августе 2006 года комиссия при Минпромэнерго по соглашениям о разделе продукции отказала американской ExxonMobil в просьбе об изменении границ месторождения Чайво, разрабатываемого в рамках проекта "Сахалин-1". Кроме того, в 2010 году претензии к "Сахалину-1" предъявила Счетная палата, считавшая, что действия американской компании сократили доходы государства от проекта.
В августе 2007 года в московском офисе рекламной компании BBDO Russia Group, входящей в американский холдинг Omnicom, прошли обыски. Правоохранительные органы безуспешно искали нелицензионное программное обеспечение.
В январе 2010 года глава Роспотребнадзора Геннадий Онищенко запретил ввоз куриного мяса из США, при санитарной обработке которого используется хлорированная вода (по этой технологии работают большинство американских производителей). Только через полгода президенты двух стран договорились о возвращении курятины из США на российский рынок.