22 октября приказом Сергея Шойгу отстранен от своей должности глава МЧС Республики Алтай Александр Афанасьев, а временно исполняющим его обязанности назначен его первый заместитель Виталий Нехаенко.
Об этом сообщил председатель комитета по ликвидации последствий землетрясения правительства Республики Алтай Александр Кулагин, не объяснив при этом причины отставки министра. Однако, по некоторым данным, отстранение от должности Афанасьева напрямую связано с разрушительным землетрясением, которое произошло на юге республики в конце сентября.Прибыв на место чрезвычайной ситуации 3 октября и познакомившись с деятельностью МЧС республики по размещению и обустройству пострадавших от стихии людей, Сергей Шойгу остался крайне недовольным. В первые дни землетрясения жителям некоторых высокогорных районов не помогали вообще.
Не была тут же организована эвакуация людей из разрушенных сел, не были развернуты лагеря для оставшихся без крова людей, они не были обеспечены всем необходимым. Кроме того жители республики о происходящих событиях были поздно проинформированы.