Лидеры Пакистана, Ирана, ОАЭ и Палестины, мусульманские религиозные авторитеты этих государств резко осудили действия террористов и выразили соболезнования народу США. На традиционной пятничной молитве имамы провели специальные заупокойные службы по жертвам терактов.
После традиционных пятничных религиозных собраний и молитв в мечетях Пакистана деятели исламского духовенства провели заупокойные службы по погибшим в США. При этом мусульманские священнослужители неоднократно провозглашали, что ислам является мирной религией, выступающей за ценность человеческой жизни. Вместе с тем, совет министров контролируемой Пакистаном части Кашмира выступил со специальным заявлением, в резких тонах осудив "новое преступление против человечества, совершенное в США". Президент страны генерал Первез Мушарраф провел уже второе по счету за последние 2 дня совещание высшего военного руководства, посвященное ситуации в регионе. Накануне Мушарраф заверил американское правительство и лично президента Джорджа Буша в поддержке американских усилий в борьбе с терроризмом.Президент Ирана Мохаммад Хатами подписал обращение с соболезнованиями народу США. Впервые с 1979 года на пятничной молитве в Тегеране была нарушена устоявшаяся традиция - верующие не скандировали привычного для них лозунга "Смерть Америке!". Вместе с тем, тысячи мусульман на традиционной пятничной службе в столице Ирана Тегеране молились о ниспослании гибели Израилю. Иранский духовный лидер аятолла Мохаммад Эмами Кашани сказал, что его “сердце разбито” из-за беспрецедентного теракта. “Как можно оставаться равнодушным после такого ужасного события? Как может кто-либо быть индифферентным к гибели невинных?” – с таким риторическим вопросом обратился аятолла к верующим по тегеранскому радио. “Эта дикая акция в Америке была подготовлена группой террористов и должна быть резко осуждена с исламской точки зрения.”, - заключил он. Вместе с тем, исламский лидер подчеркнул, что ситуация в регионе очень сложная, и действия Израиля могут оказать негативное воздействие на мусульманские страны. Иранское руководство полагает, что именно Израиль мог организовать террористические акты в США. Духовный глава Ирана аятолла Хаменеи заявил, что разработать и реализовать столь сложный план могли только силы израильского сионизма.
Религиозные руководители Объединенных Арабских Эмиратов также решительно осудили теракты в США и заявили, что убийствам невинных людей и терроризму не место в исламе, исламском обществе и истории мусульман. Министерство ОАЭ по делам религии распространило пятничную проповедь, которая была оглашена священнослужителями во всех мечетях страны.
По предложению Ясира Арафата на территории Палестинской автономии объявлен траур. В знак скорби объявлены "5 минут молчания". Телевидение Палестины неоднократно повторило кадры, запечатлевшие жителей Восточного Иерусалима и других районов автономии, которые приносят цветы к генконсульству США, ставят свечи в память погибших. 13 сентября в Палестине началась кампания по сдаче крови в помощь американским гражданам. По данным палестинских источников, Ясир Арафат в телефонном разговоре с госсекретарем США Колином Пауэллом еще раз выразил соболезнования американскому народу в связи с постигшим его горем.