В лаборатории антимикробной резистентности Института X-bio Тюменского государственного университета описан геном нового штамма бациллы Bacillus velezensis, вырабатывающего несколько антибиотиков.
Фото: CDC / Unsplash.com
Фото: CDC / Unsplash.com
Новый штамм бациллы найден аспирантом X-bio Сергеем Кравченко в Краснодарском крае. Штамм был назван коллективом авторов X-bio-1 — он открывает счет микроорганизмам, описанным в новом институте Тюменского государственного университета.
Bacillus velezensis — аэробная, грамположительная, формирующая эндоспоры свободноживущая почвенная бактерия, перспективная для разработки биопестицидов, способных подавлять развитие широкого спектра патогенов растений, в том числе бактерий, грибов и нематод. Полногеномный сиквенс был аннотирован с использованием Системы аннотирования геномов прокариот (PROKKA) и сервера технологии Системы быстрого аннотирования (RAST). Аннотированный геном нового штамма бациллы содержит 3710 белок-кодирующих и 62 РНК-кодирующих гена. Данные о новом штамме бациллы были депонированы в Генбанке (GenBank).
Научно-технический проект «Новые биопестициды на основе природных антимикробных соединений» входит в программу деятельности Западно-Сибирского научно-образовательного центра (НОЦ) Тюменской области, ХМАО-Югры и ЯНАО по направлению (тематическому фокусу) «Биобезопасность человека, животных и растений».
Работа была поддержана грантом РНФ 19-76-30005 «Модернизация методов мониторинга и контроля болезней полевых культур в России» (руководитель проекта профессор X-bio — Филипп Ганнибал).
Институт экологической и сельскохозяйственной биологии (X-bio) создан 27 ноября 2017 года как стратегическая академическая единица ТюмГУ под проект «5-100». Стратегическая цель института X-bio — поиск ответов на проблемы человечества в области экологической и продовольственной безопасности, изменения климата, антимикробной резистентности. В институте работают исследовательские группы, специализирующиеся на микрофлюидике, химии природных соединений и растениеводства, биологии почв, микробиологии и антимикробной резистентности, энтомологии, акарологии, фитопатологии и защите растений.
Использованы материалы статьи «Draft Genome Sequence of the Multiple Antibiotic Producer Bacillus velezensis X-BIO-1»; S. V. Kravchenko, D. V. Poshvina, A. V. Vasilchenko, A. S. Vasilchenko; журнал Microbiology Resource Announcement, декабрь 2020 г.