Министерство экологии и природопользования Башкирии распространило релиз, в котором объяснило причины снятия статуса памятников природы республиканского значения с Каповой пещеры (Шульган-таш) и еще пяти охраняемых объектов в марте 2014 года. Ведомство сообщило, что все охранные объекты имели двойной охранный статус — региональный и федеральный, так как располагались в границах особо охраняемых природных территорий федерального значения, а именно на территории Южно-уральского заповедника, заповедника Шульган-таш и национального парка «Башкирия». Наблюдалось дублирование статуса особо охраняемой природной территории, и минприроды России признало сохранение за памятниками республиканского охранного статуса нецелесообразным, отметили в минэкологии, уточнив, что за статус особо охраняемых территорий федерального значения «более строгий».